磁分离水净化技术是一种新兴的净化技术。磁分离技术在废水处理中的应用主要有三种：直接磁分离、间接磁分离和微生物磁分离。

磁法处理废水主要是利用污染物的凝聚性和污染物的增加性。冷凝是指含有铁磁性或顺磁性的污染物，由于磁场的作用，在凝结成表面直径增大的颗粒后被去除。利用外加的磁种增强了弱顺磁性或非磁性污染物的磁性，使其通过磁分离得以去除；利用外加的微生物吸附废水中的顺磁性离子，利用磁分离去除离子型顺磁性污染物。

近几年来，在河湖水体修复工程中，磁分离技术以其处理水量大，设备占地少，运行稳定，消除黑臭效果显著等优点，在国内许多工程中得到应用和推广。河流湖泊黑臭治理应采取常规治理和短期治理相结合的思路。正常情况下的处理，就是修建纳污管网，建设城市污水处理厂。短时间处理，即在尚未建造上述基础设施的阶段，采取短时间处理措施，不能因为不能完全达到标准而不处理。从技术原理的论证、生产工艺的设计、试验数据的分析，到后的成套设备的制作，都涉及磁力学、流体力学、材料防腐学、有机化学、生物化学等多个学科的研究，需要解决许多技术难题，如磁化絮凝、吸附打捞、排渣除泥、磁种回收、排泥、自动控制等，而且技术密集、科技含量高。